عندما يتم تفعيل نظام CNC، يتم برمجة القطع المطلوبة في البرنامج وإملائها على الأدوات والآلات المقابلة، والتي تنفذ المهام الأبعادية كما هو محدد، تمامًا مثل الروبوت.
في برمجة CNC، يفترض مولد التعليمات البرمجية داخل النظام الرقمي غالبًا أن الآليات خالية من العيوب، على الرغم من احتمالية حدوث أخطاء، والتي تكون أكبر كلما تم توجيه آلة CNC للقطع في أكثر من اتجاه في وقت واحد. يتم تحديد وضع الأداة في نظام التحكم الرقمي من خلال سلسلة من المدخلات المعروفة باسم برنامج الجزء.
في آلات التحكم الرقمي، يتم إدخال البرامج عبر بطاقات مثقبة. وعلى النقيض من ذلك، يتم تغذية برامج آلات التحكم الرقمي بالحاسوب عبر لوحات مفاتيح صغيرة. يتم الاحتفاظ ببرمجة آلات التحكم الرقمي بالحاسوب في ذاكرة الكمبيوتر. يتم كتابة الكود نفسه وتحريره بواسطة المبرمجين. وبالتالي، توفر أنظمة التحكم الرقمي بالحاسوب سعة حسابية أكثر اتساعًا. والأفضل من ذلك كله، أن أنظمة التحكم الرقمي بالحاسوب ليست ثابتة بأي حال من الأحوال حيث يمكن إضافة مطالبات أحدث إلى البرامج الموجودة مسبقًا من خلال الكود المنقح.